Solutilan ennustaminen aiemmin näkemättömissä olosuhteissa, kuten sairaudessa tai lääkkeen vaikutuksessa, on tyypillisesti vaatinut uudelleenkoulutusta jokaista uutta biologista kontekstia varten. Tänään Arc julkaisee Stackin, perustamallin, joka oppii simuloimaan solutilaa uusissa olosuhteissa suoraan päättelyhetkellä ilman hienosäätöä.

Stack tallentaa jotain, mikä useimmilla malleilla jää huomaamatta: solukontekstin. T-solu tulehtuneessa kudoksessa käyttäytyy eri tavalla, ei pelkästään omien geeniensä vuoksi, vaan myös ympäristönsä vuoksi. Pino käsittelee soluja yhteen ja oppii näistä suhteista.

Aivan kuten tekstikehotteet ohjaavat kielimalleja, solut toimivat kehotteina Stackissa. Se voi tarkkailla lääkkeillä käsiteltyjä immuunisoluja ja ennustaa, miten epiteelisolut reagoisivat samaan lääkkeeseen, tehtävään, johon ei ole koskaan nimenomaisesti koulutettu. Se on ensimmäinen yksisoluinen perustusmalli, joka pystyy oppimaan kontekstissa tai yleistämään uusia tehtäviä päättelyssä.

Tiimi sovelsi Stackia rakentaakseen Perturb Sapiensin: Atlas, jossa on ~20 000 ennustettua soluvastetta 28 kudoksella ja 201 perturbaatiolla + osajoukko, joka on validoitu pidettyjen aineistojen avulla, vahvistaen, että ennusteet kuvaavat todellista biologiaa.