Я случайно снова запустил Codex в совершенно несвязанном репозитории. Он нашел правильный репозиторий только по сообщению об ошибке (ссылка на GitHub не была предоставлена), нашел исходный код, клонировал его и начал исправлять проблему. Коммит содержал 15,3 тысячи строк кода